Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1DP3Q658K8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1DP3Q658K8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms