Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USPL1Q5W0Q7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms