Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf57Q5W0N0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms