Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms