Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms