Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AGAP6Q5VW22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AGAP6Q5VW22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms