Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFFO2Q5TF58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFFO2Q5TF58 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFFO2Q5TF58 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms