Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LGSNQ5TDP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms