Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CEP170Q5SW79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CEP170Q5SW79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms