Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHYHD1Q5SRE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHYHD1Q5SRE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms