Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms