Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP6R3Q5H9R7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6R3Q5H9R7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms