Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPAT3Q53EU6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms