Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms