Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2CQ496J9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2CQ496J9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms