Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP24-1Q3LI83 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP24-1Q3LI83 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRTAP24-1Q3LI83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRTAP24-1Q3LI83 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms