Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms