Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF4BQ2VIQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF4BQ2VIQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF4BQ2VIQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KIF4BQ2VIQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF4BQ2VIQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms