Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VWC2Q2TAL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms