Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TYSND1Q2T9J0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYSND1Q2T9J0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms