Protein–RNA interactions for Protein: Q2PPJ7

RALGAPA2, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA2Q2PPJ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RALGAPA2Q2PPJ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RALGAPA2Q2PPJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA2Q2PPJ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms