Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I3

FAM83E, Protein FAM83E, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83EQ2M2I3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83EQ2M2I3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms