Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDO1Q16878 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDO1Q16878 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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