Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPPQ16740 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPPQ16740 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPPQ16740 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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