Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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