Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDB1Q16531 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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