Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC2Q16515 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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