Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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