Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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