Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP13Q15645 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP13Q15645 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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