Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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