Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX1Q15475 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX1Q15475 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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