Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDK1Q15118 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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