Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETDB1Q15047 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETDB1Q15047 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms