Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX1Q14549 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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