Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK13Q14004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
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