Protein–RNA interactions for Protein: Q13952

NFYC, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYCQ13952 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYCQ13952 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFYCQ13952 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms