Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPSQ13938 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPSQ13938 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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