Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2H2Q13888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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