Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALKBH1Q13686 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALKBH1Q13686 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALKBH1Q13686 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALKBH1Q13686 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALKBH1Q13686 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ALKBH1Q13686 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALKBH1Q13686 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms