Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PWP1Q13610 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PWP1Q13610 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms