Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNASE1L3Q13609 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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DNASE1L3Q13609 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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DNASE1L3Q13609 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNASE1L3Q13609 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNASE1L3Q13609 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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