Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRR1Q13601 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms