Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MKRN4PQ13434 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN4PQ13434 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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