Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL49Q13405 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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