Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP2Q13309 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP2Q13309 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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