Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBX3Q13185 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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