Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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