Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms