Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN13Q12923 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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